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NEWSEVO视讯高通量外泌体蛋白组学应用
来源:王美宝 日期:2025-03-14外泌体作为机体天然信息传递的载体,在细胞间的沟通中扮演着重要角色。蛋白质是外泌体的重要组成部分,因此,通过分析外泌体的蛋白质组成,可以推动外泌体功能的深入研究。以质谱技术为基础的蛋白质组学,能够为外泌体的蛋白质组成分析提供强有力的技术支持。全面研究外泌体的蛋白质,有助于揭示外泌体及其相关蛋白在生命活动中的作用,同时也可能发掘与疾病相关的蛋白质,进而作为疾病早期诊断和预后评估的生物标志物。
为了支持这一研究方向,EVO视讯为您提供外泌体非标记定量蛋白组学(DIA和Labelfree)以及同位素标记定量蛋白组学(SILAC、iTRAQ、TMT)服务。以下是几种主要的蛋白质定量方法介绍:
iTRAQ(isobaric tagging for multiplexed relative and absolute quantitation)和TMT(tandem mass tag)是当前广泛使用的蛋白质定量技术。两者的工作原理相似,均为化学体外标记方法,不过生产商不同(iTRAQ由ABSciex提供,TMT由ThermoFisher生产)。这导致它们在标记规格和标签分子结构上存在一些差异。通过这两种方法,我们可以检测低丰度的蛋白、胞外蛋白、膜蛋白、胞浆蛋白和核蛋白等,同时能够处理多个样本,提供准确的鉴定和定量结果,适合进行比较蛋白组分析及识别差异蛋白。
SILAC(Stable Isotope Labeling by Amino Acids in Cell Culture)的基本原理是通过细胞培养,利用天然同位素轻氨基酸或稳定同位素中重氨基酸取代相应的氨基酸。经过几代培养后,稳定同位素会被完全掺入新合成的蛋白质中。不同标记的细胞或蛋白混合后,使用质谱进行鉴定。如果其峰值为1:1,则表明该蛋白的含量无差异;若含有重氨基酸的峰值偏高,则说明相应组中的该蛋白含量较高。SILAC的优点在于其标签效率高且灵敏,适合检测低丰度蛋白及其翻译后修饰,每个样本仅需几十微克材料,但其耗时较长。
Labelfree非标记(Labelfree)蛋白质定量利用液质联用技术,将蛋白质酶解成多肽并进行质谱分析,通过计算蛋白肽段的鉴定数目和色谱峰面积,实现蛋白质的相对定量。此方法的主要优势在于无需昂贵的标签作为内标,且样本制作过程较为简单,减少人为和系统误差。然而,相较于标记定量,数据分析的复杂度更高,且重复性较差,对仪器的稳定性要求也较高。此外,借助已知含量的标准蛋白,可以实现绝对定量。
DIA(Data Independent Acquisition)是近年来备受关注的质谱采集技术之一,属于非标记技术。其原理是在质谱数据采集的过程中,高速且循环地全扫描每个采集窗口内的所有母离子及其碎裂后的子离子,从而提高了定量分析的可信度,特别在复杂样品中针对低丰度蛋白质的测定。
客户可提供血清、血浆、脑脊液、尿液、胸水、腹水、唾液等体液样本,或是细胞上清、植物样本以及其他特殊样本,也可提供已经提取好的外泌体。不同生物流体样本类型要求根据后续研究目的及方法进行样本前处理。
EVO视讯是一家质谱技术驱动的创新生物科技企业,专注于外泌体精确诊疗产品的开发。我们致力于为外泌体研究提供全面的服务和产品,现有超过50种货架产品覆盖了外泌体的检测、保存以及递送等多个方面。作为国家科技中小型企业,我们积极参与科技创新,申请多项专利,并在多个知名期刊上发表研究成果。选择EVO视讯,助力您的外泌体研究与应用。
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